mysql客户端查询_MySQL数据库之利用mysql客户端查询UCSC数据库[通俗易懂]

mysql客户端查询_MySQL数据库之利用mysql客户端查询UCSC数据库[通俗易懂]本文主要向大家介绍了MySQL数据库之利用mysql客户端查询UCSC数据库,通过具体的内容向大家展现,希望对大家学习MySQL数据库有所帮助。UCSCGenomeBrowser是由UniversityofCaliforniaSantaCruz(UCSC)创立和维护的,该站点包含有人类、小鼠和大鼠等多个物种的基因组草图和注释信息,并提供一系列的网页分析工具。1.MySQL安装本人...

本文主要向大家介绍了MySQL数据库之利用mysql客户端查询UCSC数据库 ,通过具体的内容向大家展现,希望对大家学习MySQL数据库有所帮助。

UCSC Genome Browser是由University of California Santa Cruz (UCSC) 创立和维护的,该站点包含有人类、小鼠和大鼠等多个物种的基因组草图和注释信息,并提供一系列的网页分析工具。

1.MySQL安装

本人使用的是Centos6.8系统,推荐使用yum安装。

$ yum install -y mysql mysql-devel mysql-server

2.MySQLdb安装

MySQLdb是MySQL的一个线程兼容接口,提供了python数据库API,推荐yum安装。

$ yum install -y MySQL-python

3.使用脚本geneInfo.py获得基因(注,为geneSymbol名)的bed信息

$ python geneInfo.py brca1

【参考列表】

UCSC数据库

UCSC数据库表结构

本文由职坐标整理并发布,希望对同学们学习MySQL有所帮助,更多内容请关注职坐标数据库MySQL数据库频道!

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